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绘制SARS-CoV-2大只500注册链接英国变种在欧洲的主导地位



英国变异的严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2),称为B.1.1.7或VOC-202012/01,于2020年末在英国出现,并迅速传播成为几个国家的主要变异。最近一份研究报告上传到预印本服务器medRxiv * Vespignani et al。(2021年2月22日)使用数学模型映射这个家族在欧洲的传播,建立,增加了50%的遗传性变异使其成为占主导地位的主要大城市的2021年3月结束的。
 
几个欧洲城市及其大都市区也被纳入了研究:柏林、法兰克福、米兰、罗马、巴塞罗那和马德里。我们还使用了来自丹麦、希腊、波兰和葡萄牙的数据,并将受试者分为10个年龄在0 - 80岁以上的年龄组。
 
该模型假设只有B.1.1.7和野生型变异存在,并将B.1.1.7谱系的出现日期设定为2020年9月13日,传播率比野生型高50%。它包括了使用来自地方当局的数据的非药物干预措施,如封锁。研究考虑了三种情况:现状,即非药物干预和人群行为保持不变;保守松弛,即人口接触增加25%;或者适度放松,人口接触增加50%。
 
假设现状不变,B.1.1.7世系将在2月15日成为丹麦、希腊和葡萄牙的主要世系,大只500注册平台在3月15日成为波兰的主要世系,在这段时间内,主要城市的详细调查也失败了。有趣的是,放松行为对人口比例的影响相对较小,例如,截至3月31日,在现状条件下,92%的巴塞罗那SARS-SoV-2为B.1.1.7谱系,在保守和适度放松条件下,分别为93%和94%。
 
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预计到3月底,马德里、柏林、米兰和罗马的B.1.1.7血统将占主导地位,占85-94%,法兰克福的比例稍低,为74-80%。同样,预计丹麦、希腊和葡萄牙的B.1.1.7的比例为93-95%,波兰的比例较低,为72-79%。根据该模型,预计每个地区都将经历波动和不同的峰值死亡率,该模型与每个地区自2020年4月以来的每周死亡数据进行了比较,结果非常一致。
 
随后从葡萄牙、丹麦以及意大利米兰和罗马地区收集了证实SARS-CoV-2变种的PCR数据,并与模型进行了比较。该模型在95%置信区间内与B.1.1.7在人群中观察到的比例一致,表明更多的长期预测具有有效性。值得注意的是,葡萄牙只有2020年12月和2021年1月的两个数据点,而米兰和罗马只有一个。然而,在2020年12月到2021年2月之间,丹麦有7个符合预测曲线。
 
作者指出,这项研究的局限性在于没有考虑到相关地区的人口密度或流动性。此外,采用的PCR检测可能未检测到症状前或无症状个体,因此COVID-19阳性个体的数量可能被低估。
 
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后验分布- Rt.对于不同的区域,我们代表了在2020=09=01时的后验分布。这些后验分布得到了ψ = 0:5和加权平均绝对百分比误差作为公差e为0:35的距离度量。
 
这意味着什么?
 
其他基于美国和法国建模数据的研究也表明,大只500注册链接到2021年3月,B.1.1.7型将在这些国家占据主导地位。城市内进行疫苗接种运动预计不会对免疫大部分的人口在2021年的前三个月的高传播性血统可能负面抵消非药物干预,主要作者建议谨慎放松封锁程序,同时加强测试。
 
*重要通知
 
medRxiv发表的初步科学报告未经同行评议,因此不应被视为结论性的、指导临床实践/健康相关行为的,或作为既定信息对待。