大只500平台研究人员建立了癌症患者恶病质相关

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大只500平台研究人员建立了癌症患者恶病质相关


 
大只500平台研究人员建立了癌症患者恶病质相关的基因表达谱


 
据估计,多达80%的晚期癌症患者可能出现恶病质,一个潜在的致命的极端减肥和肌肉萎缩为特征的代谢综合征,但科学家们还不完全理解为什么比别人更频繁地与某些类型的肿瘤,或者为什么不是所有的癌症患者开发它。
 
肿瘤遗传学可以提供答案。巴西圣保罗州立大学(UNESP)的研究人员分析了12种癌症类型,大只500官网平台并确定了肿瘤蛋白分泌的模式,这些模式与恶病质的患病率和每种类型的平均减重有关。
 
这项研究得到了圣保罗研究基金会FAPESP的支持。首席研究员是Robson Francisco Carvalho, UNESP博图卡托生物科学研究所(IBB)的教授。南丹麦大学和哥伦比亚安提奥基亚大学医学院的研究人员也参与了这项研究。研究结果发表在《恶病质、肌肉减少症和肌肉》杂志上。
 
根据Carvalho的研究,恶病质在胰腺癌、食道癌、大肠癌、胃癌和头颈癌患者中最常见,在乳腺癌和前列腺癌患者中最不常见。
 
恶病质的诱发因素,主要来自癌症,已经与该综合征的发展相关,但尚不可能将其与这种发病率和严重程度的变化联系起来。例如,在与恶病质密切相关的胰腺癌中,我们发现25个编码恶病质诱发因素的基因中有14个的表达发生了改变。在前列腺癌中,我们发现这25个基因中的任何一个都没有发生变化。”
 
肿瘤的数据库
 
这项研究的结果是基于对两个公共肿瘤数据库的临床和分子数据的分析,这两个数据库分别是癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)项目。为了勾画出一个特定的肿瘤轮廓,研究人员使用了12种癌症的4651个样本,并将它们与来自相同器官的2737个正常组织样本进行了比较。
 
每个细胞或组织都产生一个转录组,这是一组RNA分子,负责“传递”基因编码的信息,并指导蛋白质的合成。“基于转录组分析,我们比较了肿瘤和正常组织分泌的蛋白质的基因表达谱,”Carvalho解释说。
 
这项初步分析发现了针对每种类型肿瘤的新因素,并可能解释癌症中恶病质的患病率和严重程度的差异。所有细胞蛋白编码基因的数据来自人类蛋白图谱。迄今为止,总共有2933个与蛋白稳定相关的人类基因被描述。
 
在分析了这些蛋白质的基因后,研究人员重点研究了25种生长因子和细胞因子的编码基因,这些基因被认为是引发恶病质的因素。这些包括CXCL8、IL1B、LIF、TGFA和IL6,这些在以前的研究中都是基于胰腺癌恶病质患者的血样进行分析的。
 
国立清华大学研究小组开发治疗癌症的新方法
 
卡瓦略说:“通过这种方式,我们确定了每个肿瘤类型的恶病质诱导因子的表达谱与这些癌症患者的综合征患病率和平均体重减轻之间的主要相关性。”
 
胰腺癌患者存活率低,平均减重13.7 kg (kg)。前列腺癌存活率高,平均减重不到2公斤。
 
他指出:“我们还发现了不同类型肿瘤的恶病质诱导因子的表达谱与患者预后较差(生存率较低)之间的主要相关性。”
 
终末期(难治性)恶病质患者预计生存期少于3个月。
 
生物标记物

文章中所描述的基因有可能成为发展为恶病质风险的生物标记。恶病质是一种复杂的疾病,其治疗方法仍不科学。“这表明每种类型的肿瘤都需要针对恶病质的特殊治疗,”Carvalho说。“了解这方面的知识可以帮助医生识别预后不良的患者,这将影响他们治疗的重要决定。”
 
IBB-UNESP的研究人员此前在这方面有过一项重要发现。“去年,在分析肺癌病例中的恶病质时,我们发现肿瘤分泌的IL8蛋白可导致肌肉细胞萎缩,”卡瓦略说。
 
在丹麦研究小组的合作和FAPESP的支持下,先前的研究发表在《癌症》杂志上。他解释说:“我们对肺癌和低肌肉量患者肿瘤中分泌蛋白基因表达的计算机断层扫描评估也发现了一组可用于预测预后的分子。”
 
这些知识的实际应用仍然是一个挑战。Paula Paccielli Freire在IBB-UNESP攻读博士期间进行了这项研究,她说:“在确定了这组具有显著预后价值的恶病质生物标志物之后,我们可能在未来能够建立一个评估这些基因在肿瘤组织中表达的小组。”
 
研究人员目前正在分析恶病质高发肿瘤中单个细胞的转录组,使用一种称为单细胞RNA测序的技术。迄今为止,转录组分析只能在肿瘤样本中进行,因为肿瘤中包含多种类型细胞的复杂混合物。
 
卡瓦略说:“随着单细胞RNA测序的进步,大只500平台我们现在能够准确地识别出哪些细胞分泌哪些恶病质诱导因子。”